Search results for "Genoma mēroga modeļi"

Mākslīgā intelekta izmantošana uz stehiometriskiem modeļiem bāzētu organismu celmu izvēlē un metaboliskajā inženierijā biotehnoloģijā

2021

Stehiometrisko genoma mēroga modeļu analīze ar katru gadu kļūst aizvien populārāka metode organismu analīzei, potenciālo modifikāciju meklēšanai un vispārīgi palīdz izvairīties no liekiem laboratorijas eksperimentiem. Tajā pašā laikā būtiski palielinās arī metabolisko reakciju, metabolītu un gēnu datu bāžu izmēri. Šie abi iemesli noved pie nepieciešamības pēc metodēm un algoritmiem, kas spētu apstrādāt aizvien pieaugošos datus un atvieglot metabolisko modeļu izveidi un apstrādi. Šajā darbā tiek izstrādāts kStrainAlgorithm, kurš izmanto ģenētiskos algoritmus, lai pildītu trīs galvenās funkcijas: 1) spēt identificēt nepieciešamās reakcijas genoma mēroga stehiometriskā modeļa darbībai, 2) izma…